Les poissons se sont adaptés à l’environnement alpin et son régime de cours d’eau torrentiels.
La faune halieutique du territoire du Parc comprend deux importants salmonidés: la truite fario (Salmo trutta trutta), présente dans tous les environnements aquatiques du Parc: des sources aux ruisseaux et petits torrents latéraux, jusqu’aux gros cours d’eau marécageux et aux bassins artificiels, ainsi que la truite marbrée (Salmo trutta marmoratus). Généralement, la truite fario est l’espèce dominante dans les cours d’eau mineurs, mais sa densité tend à diminuer par rapport à la marbrée dans les cours d’eau de plus grandes dimensions comme le torrent Cordevole et le tronçon inférieur du torrent Mis.
Le Parc accueille également le Chabot commun (Cottus gobio), espèce indigène très sensible aux altérations environnementales et à la pollution. Il montre aujourd’hui être en lente mais constante voie de reprise.
D’autres espèces sont présentes, mais de manière plus discontinue: l’Omble de fontaine, le Vairon, la Truite arc-en-ciel, l’Ablette et le Chevaine.